ينقسم موضوع هذا الفيلم إلى جزئين يرصدان مراحل مختلفة من حياة المفكر العربي مصطفى محمود. يتابع هذا العمل حياة هذا المفكر ويتتبع مسيرته العلمية وكتاباته وتأثيره في محيطه العربي والإسلامي ويرصد مرحلة الشك التي مر بها فكريا قبل ان يحسمها إلى الابد ويسلط الضوء على حقائق جديدة لم تكن معروفة من قبل مثل ضغوط الجماعات الصهوينية علي جريدة الأهرام لوقف مقالات الدكتور محمود و وكيف وصلت الضغوط إلي حد مخاطبة أسامه الباز سكرتير رئيس الجمهورية للمعلومات للأهرام بهذا الصدد ، ويتناول أيضاً مقالات مصطفي محمود في قضية الشفاعة والتي كتبها في أيامه الأخيرة وأثارت عليه الكثير من ردود الفعل التي وصل بعضها لدرجة الحملات الإعلامية ، كما يرصد هذا الجزء تجربته الفريدة في تقديم برنامجه الشهير "العلم والإيمان"، و ويستعرض ايضا المتحف الذي أسسه كنادي للعلماء ونشاطه الخيري الكبير في جمعية مسجد محمود .